20200101のMacに関する記事は4件です。

投稿日：2020-01-01T14:30:41+09:00

pyenvでインストールしたanacondaのJupyter Notebookをzshで使う（不具合対応）

概要

事の起こりは2019年末，Jupyter Notebookを久しぶりに動かそうとしたら起動できなかった．
色々と調べた結果，ターミナルをbashからzshに変更したことで，パス設定を直さなければいけないことが分かったけれど，自分の場合はpyenvでanacondaを入れていたので，さらにややこしいことになっていた．

症状

ターミナルから”Jupyter Notebook”と打つと，”zsh: command not found: jupyter”と返ってくる

ターミナルからPythonのバージョンを確認すると，macにデフォルトで入っていた古いバージョンが出てくる

anaconda navigaterからJupyter Notebookの起動はできる

jupyter notebookが起動しなくなった原因はconda init zsh? を参考にパスを設定するも，不具合が解決しない（そもそも，”Users/$$$（ユーザー名）/anaconda3/bin”のパスが参照するフォルダがない）

環境

Mac OS Mojave
anacondaをpyenvでインストール

パスを設定する方法

1. ".zshrc"を起動
Terminal
$ open ~/.zshrc
2. ".zshrc"にpyenvのパスを書き込む
.zshrc
export PYENV_ROOT="$HOME/.pyenv"
export PATH="$PYENV_ROOT/bin:$PATH"
eval "$(pyenv init -)"
3. シェルを再起動
Terminal
$ exec $SHELL -l
4. パスが通っていることを確認する
Terminal
$ which python
”/Users/$$$（ユーザー名）/.pyenv/shims/python”と返ってきたのでOK

5. Jupyter Notebookの起動を確認
Terminal
$ Jupyter notebook
参考にさせていただいたサイト

jupyter notebookが起動しなくなった原因はconda init zsh?

macOS CatelinaにAnacondaをインストールする（zshでの不具合対応）

pyenvを使ってMacにPythonの環境を構築する

シェルを再起動させる簡単な方法

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投稿日：2020-01-01T14:30:41+09:00

pyenvでインストールしたanacondaのJupyter NotebookをZshで使う（不具合対応）

概要

事の起こりは2019年末，Jupyter Notebookを久しぶりに動かそうとしたら起動できなかった．
色々と調べた結果，ターミナルをbashからzshに変更したことで，パス設定を直さなければいけないことが分かったけれど，自分の場合はpyenvでanacondaを入れていたので，さらにややこしいことになっていた．

症状

ターミナルから”Jupyter Notebook”と打つと，”zsh: command not found: jupyter”と返ってくる

ターミナルからPythonのバージョンを確認すると，macにデフォルトで入っていた古いバージョンが出てくる

anaconda navigaterからJupyter Notebookの起動はできる

jupyter notebookが起動しなくなった原因はconda init zsh? を参考にパスを設定するも，不具合が解決しない（そもそも，”Users/$$$（ユーザー名）/anaconda3/bin”のパスが参照するフォルダがない）

環境

Mac OS Mojave
anacondaをpyenvでインストール

パスを設定する方法

1. ".zshrc"を起動
Terminal
$ open ~/.zshrc
2. ".zshrc"にpyenvのパスを書き込む
.zshrc
export PYENV_ROOT="$HOME/.pyenv"
export PATH="$PYENV_ROOT/bin:$PATH"
eval "$(pyenv init -)"
3. シェルを再起動
Terminal
$ exec $SHELL -l
4. パスが通っていることを確認する
Terminal
$ which python
”/Users/<ユーザー名>/.pyenv/shims/python”と返ってきたのでOK

5. Jupyter Notebookの起動を確認
Terminal
$ Jupyter notebook
参考にさせていただいたサイト

jupyter notebookが起動しなくなった原因はconda init zsh?

macOS CatelinaにAnacondaをインストールする（zshでの不具合対応）

pyenvを使ってMacにPythonの環境を構築する

シェルを再起動させる簡単な方法

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投稿日：2020-01-01T11:49:25+09:00

Macをクリーンアップして作業環境を構築した時の備忘録

年末にプライベートで使ってるMacBook Air（2014年に買ったそこそこ古いやつ）をクリーンアップして諸々設定したのでその時のメモ

やったことは
1. ハードディスク初期化
2. homebrewインストール
3. githubにssh登録
4. githubからmac設定用のansibleをcloneして実行
5. githubからdotfile落としてきてローカルに適用

ハードディスク初期化

command + R 押しっぱなしで再起動してディスクユーティリティからHD初期化してOS入れ直して、後は画面通りに設定していけば終わる。
消したくないファイルはGoogle Drive、写真はGoogle Photo、メモはsimplenoteに全て入れておく

homebrewインストール

公式サイトで落としてくれば終わり

githubにssh登録
$HOME/.ssh
で
ssh-keygen -t rsa
生成された鍵をここに登録

githubからmac設定用のansibleをcloneして実行

まずansibleをmacにインストールする。
その後によく使うアプリをmacにインストールするansibleを作っておいたのでそれを実行した。
が、エラーメッセージが出て落ちた
failed: [localhost] (item=caskroom/cask) => {"ansible_loop_var": "item", "changed": false, "item": "caskroom/cask", "msg": "added: 0, unchanged: 0, error: failed to tap: caskroom/cask"}
ググったらhomebrewでGUI入れる機能が本体に統合されたようなのでここはansibleから消した。

githubからdotfile落としてきてローカルに適用

設定ファイルをgithubにおいてあるのでそれをシェルでローカルに適用した。
- ansibleの前に実行しようとしたが、rbenv、ndenv、starshipがインストールされていること前提の内容になっていたので先にansible実行しないといけなかった
- シェルを実行してls -la $HOMEしたけどbashrc、bash_profileがなかった。。macって最初ないんだっけ。。しょうがないのでtouchで空ファイル作って再実行したら動いた。

これで作業環境としては大分いつも通りになった感じあるけど、実際開発してみると足りないもの諸々あるんだろうなとか、、

そろそろmac買い換えたいので近いうちにまたやる気がする

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投稿日：2020-01-01T00:23:51+09:00

macにleveldb-nativeをgemでインストールする

GoogleのBigTableの概念を参考に作られたKeyValue型データストアであるLevelDBを、macのruby環境にインストールする方法について説明します。この記事では、leveldb-rubyではなく、leveldb-native(C++実装)について触れています。
いつもながら素人記事ですので、コメントありましたらぜひお寄せください！

実行環境

実行日: 2019-12-25
OS version: MacOS Mojave 10.14.6
Ruby version: 2.6.3
leveldb version: 0.6

事象

上記実行環境でleveldb-nativeをgemでインストールしようとすると、次のようなコンパイルエラーが出て、インストールできません。

[ 19-12-24 19:34 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem install leveldb-native
Building native extensions. This could take a while...
ERROR:  Error installing leveldb-native:
    ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native
/Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/bin/ruby -I /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/lib/ruby/site_ruby/2.6.0 -r ./siteconf20191224-34602-37ap6f.rb extconf.rb
checking for -lleveldb... yes
creating Makefile

current directory: /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native
make "DESTDIR=" clean

current directory: /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native
make "DESTDIR="
compiling leveldb-native.cc
In file included from leveldb-native.cc:4:
In file included from /usr/local/include/leveldb/db.h:12:
In file included from /usr/local/include/leveldb/iterator.h:19:
/usr/local/include/leveldb/slice.h:43:25: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Slice(const Slice&) = default;
                        ^
/usr/local/include/leveldb/slice.h:44:36: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Slice& operator=(const Slice&) = default;
                                   ^
In file included from leveldb-native.cc:4:
In file included from /usr/local/include/leveldb/db.h:12:
In file included from /usr/local/include/leveldb/iterator.h:20:
/usr/local/include/leveldb/status.h:27:11: error: expected ';' at end of declaration list
  Status() noexcept : state_(nullptr) {}
          ^
          ;
/usr/local/include/leveldb/status.h:33:16: warning: rvalue references are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Status(Status&& rhs) noexcept : state_(rhs.state_) { rhs.state_ = nullptr; }
               ^
/usr/local/include/leveldb/status.h:33:23: error: expected ';' at end of declaration list
  Status(Status&& rhs) noexcept : state_(rhs.state_) { rhs.state_ = nullptr; }
                      ^
                      ;
/usr/local/include/leveldb/status.h:103:16: error: 'Status' is missing exception specification 'throw()'
inline Status::Status(const Status& rhs) {
               ^
                                         throw()
/usr/local/include/leveldb/status.h:24:22: note: previous declaration is here
class LEVELDB_EXPORT Status {
                     ^
/usr/local/include/leveldb/status.h:115:40: warning: rvalue references are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
inline Status& Status::operator=(Status&& rhs) noexcept {
                                       ^
/usr/local/include/leveldb/status.h:115:48: error: expected function body after function declarator
inline Status& Status::operator=(Status&& rhs) noexcept {
                                               ^
In file included from leveldb-native.cc:4:
In file included from /usr/local/include/leveldb/db.h:12:
/usr/local/include/leveldb/iterator.h:28:31: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Iterator(const Iterator&) = delete;
                              ^
/usr/local/include/leveldb/iterator.h:29:42: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Iterator& operator=(const Iterator&) = delete;
                                         ^
/usr/local/include/leveldb/iterator.h:80:27: warning: alias declarations are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  using CleanupFunction = void (*)(void* arg1, void* arg2);
                          ^
In file included from leveldb-native.cc:4:
In file included from /usr/local/include/leveldb/db.h:13:
/usr/local/include/leveldb/options.h:49:26: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool create_if_missing = false;
                         ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:52:24: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool error_if_exists = false;
                       ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:59:24: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool paranoid_checks = false;
                       ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:69:20: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Logger* info_log = nullptr;
                   ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:82:28: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  size_t write_buffer_size = 4 * 1024 * 1024;
                           ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:87:22: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  int max_open_files = 1000;
                     ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:94:22: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Cache* block_cache = nullptr;
                     ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:100:21: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  size_t block_size = 4 * 1024;
                    ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:105:30: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  int block_restart_interval = 16;
                             ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:115:24: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  size_t max_file_size = 2 * 1024 * 1024;
                       ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:131:31: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  CompressionType compression = kSnappyCompression;
                              ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:137:19: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool reuse_logs = false;
                  ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:142:37: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  const FilterPolicy* filter_policy = nullptr;
                                    ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:147:19: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  ReadOptions() = default;
                  ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:151:25: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool verify_checksums = false;
                        ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:155:19: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool fill_cache = true;
                  ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:161:28: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  const Snapshot* snapshot = nullptr;
                           ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:166:20: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  WriteOptions() = default;
                   ^
/usr/local/include/leveldb/options.h:182:13: warning: in-class initialization of non-static data member is a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  bool sync = false;
            ^
In file included from leveldb-native.cc:4:
/usr/local/include/leveldb/db.h:56:10: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  DB() = default;
         ^
/usr/local/include/leveldb/db.h:58:19: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  DB(const DB&) = delete;
                  ^
/usr/local/include/leveldb/db.h:59:30: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  DB& operator=(const DB&) = delete;
                             ^
In file included from leveldb-native.cc:5:
/usr/local/include/leveldb/cache.h:36:13: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Cache() = default;
            ^
/usr/local/include/leveldb/cache.h:38:25: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Cache(const Cache&) = delete;
                        ^
/usr/local/include/leveldb/cache.h:39:36: warning: deleted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Cache& operator=(const Cache&) = delete;
                                   ^
In file included from leveldb-native.cc:6:
/usr/local/include/leveldb/write_batch.h:45:35: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  WriteBatch(const WriteBatch&) = default;
                                  ^
/usr/local/include/leveldb/write_batch.h:46:46: warning: defaulted function definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  WriteBatch& operator=(const WriteBatch&) = default;
                                             ^
34 warnings and 4 errors generated.
make: *** [leveldb-native.o] Error 1

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/leveldb-native-0.6 for inspection.
Results logged to /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/extensions/x86_64-darwin-18/2.6.0/leveldb-native-0.6/gem_make.out

当然、irbからleveldb-nativeを使おうとするとエラーになります。

[ 19-12-24 19:43 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% irb
2.6.3 :001 > require 'leveldb-native'
Traceback (most recent call last):
        8: from /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/ruby_executable_hooks:24:in `<main>'
        7: from /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/ruby_executable_hooks:24:in `eval'
        6: from /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/irb:23:in `<main>'
        5: from /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/irb:23:in `load'
        4: from /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/irb-1.2.1/exe/irb:11:in `<top (required)>'
        3: from (irb):2
        2: from /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/lib/ruby/site_ruby/2.6.0/rubygems/core_ext/kernel_require.rb:54:in `require'
        1: from /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/lib/ruby/site_ruby/2.6.0/rubygems/core_ext/kernel_require.rb:54:in `require'
LoadError (cannot load such file -- leveldb-native)

解決策

事象の34個のwarningを見ると、「C++11 extension」で定義された関数が正しく使えていないようなことが見れます。また、4個のerrorを見ると、文法間違い扱いとなっているようで、コンパイルが通らない様になっているようです。
どうやら、私の実行環境はC++標準が古いようで、インストールするためには、コンパイル時のオプションでC++11以降を指定する必要があるようです。そこで、次のようにしてインストールするgemファイルを編集してからインストールすることにします。

手順1. ダウンロード

gem fetchで、インストールするgemファイルをダウンロードします。

[ 19-12-25 9:41 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem fetch leveldb-native 
Fetching leveldb-native-0.6.gem
Downloaded leveldb-native-0.6

[ 19-12-25 9:41 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% ls
leveldb-native-0.6.gem

手順2. 展開

gem unpackで、gemファイルを展開します。

[ 19-12-25 9:41 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem unpack leveldb-native-0.6.gem 
Unpacked gem: '/Users/osada/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6'

[ 19-12-25 9:42 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% ls
leveldb-native-0.6/
leveldb-native-0.6.gem

手順3. extconf.rbの編集

leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native/extconf.rbに、コンパイル時に指定するオプションに情報を追記します。

leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native/extconf.rb

require 'mkmf'

have_library "leveldb" or abort "Can't find leveldb library."
$CXXFLAGS += " -std=c++11 "   # <= ココ!!!
create_makefile "leveldb-native/leveldb_native"

$CXXFLAGSに、-std=c++11を追加するわけです。-stdの前の半角スペースと、11の後ろの半角スペースを忘れずに。
ちなみに、このmkmfというパッケージはMakefileを生成するrubyのモジュールのようです。

手順4. gemspecの作成

gem fetch / gem unpackしたファイルには、gemspecがありません。次のように手動で作成します。

[ 19-12-25 14:19 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem spec --ruby leveldb-native-0.6.gem > leveldb-native-0.6.gemspec

[ 19-12-25 14:19 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% ls
leveldb-native-0.6/  leveldb-native-0.6.gem  leveldb-native-0.6.gemspec

手順5. buildの実行

手順4.で作成したgemspecファイルを適切な場所に配置して、編集した手順3.を含んだleveldb-nativeをgem buildします。

[ 19-12-25 14:19 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% mv leveldb-native-0.6.gemspec leveldb-native-0.6

[ 19-12-25 14:19 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% cd leveldb-native-0.6

[ 19-12-25 14:20 ] ~/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6
osada@mbp17e% gem build leveldb-native-0.6.gemspec                       
WARNING:  open-ended dependency on rake (>= 0.9, development) is not recommended
  if rake is semantically versioned, use:
    add_development_dependency 'rake', '~> 0.9'
WARNING:  See http://guides.rubygems.org/specification-reference/ for help
  Successfully built RubyGem
  Name: leveldb-native
  Version: 0.6
  File: leveldb-native-0.6.gem

[ 19-12-25 14:20 ] ~/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6
osada@mbp17e% ls
LICENSE                     example/                    leveldb-native-0.6.gemspec
README.md                   ext/                        lib/
Rakefile                    leveldb-native-0.6.gem      test/

まあ、なにかwarningが出ますが、無事新しいleveldb-native-0.6.gemが生成されました。

手順6. インストール

新しいgemファイルをinstallします。このとき、"./"を忘れずに。

[ 19-12-25 14:20 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem install ./leveldb-native-0.6.gem
Building native extensions. This could take a while...
Successfully installed leveldb-native-0.6
Parsing documentation for leveldb-native-0.6
Installing ri documentation for leveldb-native-0.6
Done installing documentation for leveldb-native after 0 seconds
1 gem installed

手順7. 使ってみる

[ 19-12-25 14:20 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% irb
2.6.3 :001 > require 'leveldb-native'
 => true 
2.6.3 :002 >

できた！

原因調査

環境調査

C++のバージョンやgemの環境変数を確認します。

[ 19-12-24 19:47 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% which c++
/usr/bin/c++

[ 19-12-24 19:59 ] ~/workspace/bitcoinrb
osada@mbp17e% gem environment
RubyGems Environment:
  - RUBYGEMS VERSION: 3.0.6
  - RUBY VERSION: 2.6.3 (2019-04-16 patchlevel 62) [x86_64-darwin18]
  - INSTALLATION DIRECTORY: /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb
  - USER INSTALLATION DIRECTORY: /Users/osada/.gem/ruby/2.6.0
  - RUBY EXECUTABLE: /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/bin/ruby
  - GIT EXECUTABLE: /usr/bin/git
  - EXECUTABLE DIRECTORY: /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin
  - SPEC CACHE DIRECTORY: /Users/osada/.gem/specs
  - SYSTEM CONFIGURATION DIRECTORY: /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/etc
  - RUBYGEMS PLATFORMS:
    - ruby
    - x86_64-darwin-18
  - GEM PATHS:
     - /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb
     - /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/lib/ruby/gems/2.6.0
  - GEM CONFIGURATION:
     - :update_sources => true
     - :verbose => true
     - :backtrace => false
     - :bulk_threshold => 1000
  - REMOTE SOURCES:
     - https://rubygems.org/
  - SHELL PATH:
     - /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin
     - /Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@global/bin
     - /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/bin
     - /Users/osada/.rvm/bin
     - /usr/local/opt/jpeg-turbo/bin
     - /Users/osada/.pyenv/shims
     - /Users/osada/.pyenv/bin
     - /usr/local/bin
     - /usr/bin
     - /bin
     - /usr/sbin
     - /sbin
     - /Applications/VMware Fusion.app/Contents/Public
     - /Library/TeX/texbin
     - /usr/local/share/dotnet
     - /Applications/Wireshark.app/Contents/MacOS
     - /sbin
     - /usr/local/bin
     - /Users/osada/bin

Makefile/Rakefile/extconf周辺

leveldb-naitiveは、nativeという言葉が意味する通り、C++でコンパイルしたバイナリで動作します。というわけで、Makefileを使う"make"でインストールすることになります。一方で、gemはrubyのパッケージマネージャであって、ここではRakefileを使う"rake"でインストールことになります。

Makefileの中に色々なコンパイルオプションが書かれていますが、ここではCXXFLAGSに注目して書いてみて、makeするとうまくコンパイルが通るようになります。

[ 19-12-25 13:12 ] ~/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6/ext/leveldb-native
osada@mbp17e% make
compiling leveldb-native.cc
In file included from leveldb-native.cc:1:
In file included from /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/include/ruby-2.6.0/ruby.h:33:
In file included from /Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/include/ruby-2.6.0/ruby/ruby.h:2111:
/Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/include/ruby-2.6.0/ruby/intern.h:56:19: warning: 
      'register' storage class specifier is deprecated and incompatible with
      C++17 [-Wdeprecated-register]
void rb_mem_clear(register VALUE*, register long);
                  ^~~~~~~~~
/Users/osada/.rvm/rubies/ruby-2.6.3/include/ruby-2.6.0/ruby/intern.h:56:36: warning: 
      'register' storage class specifier is deprecated and incompatible with
      C++17 [-Wdeprecated-register]
void rb_mem_clear(register VALUE*, register long);
                                   ^~~~~~~~~
leveldb-native.cc:205:3: warning: 'auto_ptr<bound_db>' is deprecated
      [-Wdeprecated-declarations]
  auto_ptr<bound_db> db(new bound_db);
  ^
/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1/memory:2080:28: note: 
      'auto_ptr<bound_db>' has been explicitly marked deprecated here
class _LIBCPP_TEMPLATE_VIS _LIBCPP_DEPRECATED_IN_CXX11 auto_ptr
                           ^
/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1/__config:1101:39: note: 
      expanded from macro '_LIBCPP_DEPRECATED_IN_CXX11'
#  define _LIBCPP_DEPRECATED_IN_CXX11 _LIBCPP_DEPRECATED
                                      ^
/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1/__config:1090:48: note: 
      expanded from macro '_LIBCPP_DEPRECATED'
#    define _LIBCPP_DEPRECATED __attribute__ ((deprecated))
                                               ^
3 warnings generated.
linking shared-object leveldb-native/leveldb_native.bundle

ただし、このままだとgemとして使うことができません。そこで、このMakefileを生成するrakeコマンドを見ていくわけです。rakeは、引数を指定して実行する必要があります。ここではextを選びます。

[ 19-12-25 13:11 ] ~/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6
osada@mbp17e% rake --task
rake clean         # Clean compiled files
rake dist_clean    # Clean compiled files and Makefile
rake ext           # Build extension
rake release       # Test, commit, tag, and push repo; build and push gem
rake release:diff  # Diff to latest release
rake release:log   # Log to latest release
rake test          # Run tests for {:test=>:ext}

[ 19-12-25 13:11 ] ~/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6
osada@mbp17e% rake ext   
cd ext/leveldb-native && ruby extconf.rb
checking for -lleveldb... yes
creating Makefile  ## <= ココ!!!
cd ext/leveldb-native && make
compiling leveldb-native.cc
In file included from leveldb-native.cc:4:
In file included from /usr/local/include/leveldb/db.h:12:
In file included from /usr/local/include/leveldb/iterator.h:19:
/usr/local/include/leveldb/slice.h:43:25: warning: defaulted function definitions
      are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  Slice(const Slice&) = default;
                        ^
(略)
/usr/local/include/leveldb/write_batch.h:46:46: warning: defaulted function
      definitions are a C++11 extension [-Wc++11-extensions]
  WriteBatch& operator=(const WriteBatch&) = default;
                                             ^
34 warnings and 4 errors generated.
make: *** [leveldb-native.o] Error 1
rake aborted!
Command failed with status (2): [cd ext/leveldb-native && make...]
/Users/osada/workspace/bitcoinrb/leveldb-native-0.6/Rakefile:28:in `block in <top (required)>'
/Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/gems/rake-13.0.1/exe/rake:27:in `<top (required)>'
/Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/ruby_executable_hooks:24:in `eval'
/Users/osada/.rvm/gems/ruby-2.6.3@bitcoinrb/bin/ruby_executable_hooks:24:in `<main>'
Tasks: TOP => ext => ext/leveldb-native/leveldb_native.so
(See full trace by running task with --trace)

Makefileを作っていることがわかりますね。rakeが指定するRakefileを見てみましょう。

Rakefile

desc "Build extension"
task :ext => File.join(ext_dir, so_name)

file File.join(ext_dir, so_name) => FileList[
       File.join(ext_dir, "*.{c,cc,h}"),
       File.join(ext_dir, "Makefile")] do
  sh "cd #{ext_dir} && make"
end

file File.join(ext_dir, "Makefile") => File.join(ext_dir, "extconf.rb") do
  sh "cd #{ext_dir} && ruby extconf.rb"
end

上記はextタスク部分を取り出したものです。Makefile作成にには、ext_dirにある"extconf.rb"をrubyで実行していることがわかります。

これを見に行くと、手順3に繋がります。

いや〜、C++の標準の違いは利用者も意識する必要があるので、骨が折れますね。c++11なのかc++14なのか、はたまたc++17なのか。コンパイルオプション"-std=xxx"で指定する部分は環境変数でなんとかならないものなんでしょうかね。

参考サイト

LevelDBとは
- https://yosuke-furukawa.hatenablog.com/entry/2014/05/05/095207
Unsupported leveldb 1.21 on MacOS
- https://github.com/wbolster/plyvel/issues/95
How to add a C++ compiler flag to extconf.rb
- https://stackoverflow.com/questions/3735391/how-to-add-a-c-compiler-flag-to-extconf-rb
インストールできない gem を修正してインストールする
- http://blog.livedoor.jp/denpa_yunyun/archives/52476081.html

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pyenvでインストールしたanacondaのJupyter Notebookをzshで使う（不具合対応）

概要

症状

環境

パスを設定する方法

1. ".zshrc"を起動

2. ".zshrc"にpyenvのパスを書き込む

3. シェルを再起動

4. パスが通っていることを確認する

5. Jupyter Notebookの起動を確認

参考にさせていただいたサイト